肛周膿腫和肛瘺這兩個病，絕大部分是肛腺引起的感染，肛周膿腫屬于感染早期、急性期，肛瘺多數屬于炎癥遷延期、慢性期，這兩個手術在時機上有差別，所以手術方式也相對有差別。肛周膿腫在急性炎癥期，以切開引流排膿為主，根治的同時還要保留肛門的括約肌、肛門的功能。因為在急性期，局部炎癥還沒有機化，如果瞬間切開括約肌，會出現明顯的收縮，造成肛門功能損傷。如果在內部處理，則要以掛線為主。對于前部的膿腫，也可以直接切開，但多數是不能縫合的刀口。肛瘺是慢性炎癥期，肛瘺手術可以選擇的方式就比較多，常見的有肛瘺剔除、內口封堵、肛瘺栓，或者是肛瘺內口黏膜瓣推移，瘺管結扎，瘺管剔除之后，將肛門括約肌保留，也就是LIFT術(經括約肌間瘺管結扎術)。還有一些肛瘺掛線、肛瘺的切除。因此，肛瘺手術的方式相對比較多，兩個雖然都是根治性手術，但是處理起來還是有一些差別，不能完全混淆，但是本質就是把感染的原發灶清除掉。