目前胃腸道身心疾病的發(fā)病機理不是特別清楚，可能跟心理因素、飲食、腸道感染、內(nèi)臟感覺異常、胃腸動力變化以及遺傳因素、環(huán)境因素都有關(guān)系。現(xiàn)在醫(yī)學(xué)研究可以證明心理因素，特別是應(yīng)激狀態(tài)下的胃腸動力和內(nèi)臟感覺會發(fā)生變化，這方面的因素可能更多一點。所以心理因素、社會因素可能在胃腸道身心疾病中占有更重要的比重。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)提出了腦腸軸的概念，腦就是腦子，腸就是腸道。腦腸軸，就是精神因素或者外界環(huán)境因素刺激，通過中樞神經(jīng)系統(tǒng)作用于胃腸道系統(tǒng)、消化系統(tǒng)，造成內(nèi)臟感覺、胃腸動力改變，導(dǎo)致胃腸身心疾病。