惡性胃腸道間質瘤的靶向藥物目前我們國家獲批的有五個，一線的伊馬替尼、二線的舒尼替尼、三線的瑞戈非尼、四線的瑞派替尼，以及針對D842V突變的阿伐替尼。伊馬替尼是惡性胃腸道間質瘤的一線治療藥物，舒尼替尼和瑞戈非尼是一線治療失敗后的二線和三線的治療選擇，有效延長了患者的疾病無進展生存期，但不良反應較嚴重。瑞派替尼是惡性胃腸道間質瘤的四線藥物治療，安全性和耐受性良好。阿伐替尼針對PDGFRα 、D842V突變患者。對于惡性胃腸道間質瘤患者，胃的中危患者術后藥物輔助治療的時間是1年，高危及非胃的中危患者，術后藥物輔助治療時間為3年，腫瘤破裂者需要更長時間的藥物輔助治療。自從靶向藥物應用于胃腸道間質瘤治療以來，復發轉移或無法手術切除的患者，其中位生存期已從1年提高到5年以上，甚至20%的患者生存期可以超過10年。這在20多年前幾乎無法想象，因此患者需要在醫生指導下進行藥物的靶向治療。