腔隙性腦梗死的治療主要分為急性期治療和急性期過后進行預防治療。如果出現了腔隙性腦梗死，在急性期可能會有頭暈、較輕微的肢體運動或感覺障礙，可以通過溶栓、保護線粒體、清除自由基、抗血小板聚集等治療改善癥狀，還可使用腦保護藥物，促進腦部功能的恢復。一般情況下，腔隙性腦梗死并不會出現后遺癥，但是需要對于疾病復發進行預防，可以使用拜阿司匹林、葉酸片、維生素C、維生素E等預防腦梗死的再次發生。