智齒含牙囊腫和頜骨囊腫是一樣的，要嚴格地按照頜骨囊腫手術的操作流程，把囊腫刮治干凈。術中要把智齒和囊腫一起切除，將囊壁完全地刮治干凈。在囊腫對周圍的骨質破壞比較嚴重的情況下，還需要用金剛砂球鉆將周圍的骨質磨除一部分，這樣囊腫以后就不容易復發。如果不及時地切除，囊腫會逐漸地增大。臨床見到的囊腫有的已經長得像雞蛋那么大，但是卻沒有明顯的感覺。當它大到一定程度的時候，就會波及到周圍的骨組織和神經，甚至造成病人下唇的麻木。囊腫過大也容易發生病理性的骨折，而且囊腫如果反復發炎以后，也會容易引起癌變，所以建議術中將牙齒及囊腫完全地刮治干凈，可以避免術后復發。