對于鼻咽癌的預防，目前的研究中較為肯定的致病因素有三個方面，所以預防即是從較肯定的致病因素方面進行，分別是EB病毒感染、化學致癌因素、遺傳因素，其中EB病毒感染目前尚無特效的治療藥物，但在國內外已有一些研究，不過還未進入臨床應用階段。化學致癌因素是鼻咽癌預防的一個主要方面，也是散發鼻咽癌的一個主要原因，盡量避免或少量進食咸魚、腌肉、腌菜等腌制類食品，減少攝入過多的亞硝酸鹽到身體內，同時不吸煙、少飲酒，培養健康的飲食習慣和良好的生活方式，可在一定程度上降低鼻咽癌的發病幾率。鼻咽癌也有家族聚集現象，所以對于這一部分人群需定期檢查，才可能有助于早期發現鼻咽癌。