胃鏡可以查出食管癌和胃癌，而且是食管癌和胃癌重要的檢查方法。胃鏡檢查是用纖維胃鏡通過口腔進入到咽部、喉部、胃以及十二指腸，可以清楚觀察到上述器官的內壁情況，當胃癌、食管癌的分型較典型，如表面有菜花狀的潰瘍時，即可在胃鏡下進行診斷。對于部分并不是十分典型的患者，則需要進行活體組織檢查進行確診，因此胃鏡既可以檢查器官，同時還可以通過夾取病變組織做活體組織檢查，進行病理性診斷，只有病理性診斷才是確診的唯一方法。不論是胃癌，還是食管癌，在最終明確病情以后，均建議早期進行手術治療。目前對于早期的胃癌或食管癌患者，可以通過胃鏡下進行ESD切除(內鏡黏膜下剝離術)，從而達到根治，而對于進展期的患者，則需要通過手術來進行治療，目前手術方式有開放的腹腔鏡微創，以及達芬奇機器人微創等。對于部分患者如果在胃鏡下考慮是胃癌或食管癌，但取病理后沒有判定，通常建議再進行胃鏡下的活體組織檢查進行取材，以進一步明確該病變的性質。