通常情況下，不能吃豆制品的疾病主要是以腎病為主，尤其是糖尿病合并腎病3期以上，不建議吃豆制品。豆制品包含一定的植物蛋白，會分解成白蛋白、球蛋白，或進一步在腎臟內分解、轉化、合成和利用，以β2-微球蛋白和α球蛋白為主，會對腎臟腎小球濾過率和腎小管重吸收率造成一定的負擔和負荷。通常對于糖尿病合并腎病，尤其是合并腎病綜合征的患者，不建議吃豆制品。對于慢性腎功能不全，包括慢性腎小球腎炎、慢性腎小管疾病、IgA腎病，嚴重時也不可以吃豆制品。除豆制品外，其他包含豆類的食物也不建議患有腎病的患者經常攝取。此外，糖尿病合并腎病、痛風或泌尿系統結石的患者，也不建議長期大量攝入豆制品。