移行上皮覆蓋于腎盂、輸尿管、膀胱以及男性尿道前列腺段，如果發生癌變，則稱為尿路上皮癌。因為移行上皮的廣覆蓋性，所以多數情況可發生于腎盂、輸尿管和膀胱。尿液中也會出現移行上皮，根據尿液中的移行上皮，可以分為表型移行上皮，通常來源于膀胱，中層移行上皮來源于腎盂，而底層移行上皮來源于輸尿管、膀胱和尿道。如果尿液中檢查出現了移行上皮增多，通常情況下提示尿路感染，如急性腎盂腎炎、膀胱炎、輸尿管炎、尿道炎等。如果尿液中出現大量移行上皮，要注意是否存在移行上皮癌的可能，通常需要結合其它輔助檢查手段明確是否存在惡性情況。