黃連素不是抗生素，又稱鹽酸小檗堿片，主要有效成分是小檗堿，是一種生物堿，對病原菌只起到微弱的抗菌作用；優勢是對腸道的病原菌能起到一定的治療作用，特別是痢疾桿菌。黃連素在臨床上主要用于胃腸道感染，如可以用于治療感染導致的腹瀉和腹部不適。使用黃連素時需注意，由于其是一種生物堿，容易和含有鞣質的藥物發生沉淀，特別是中藥類的物質，從而影響藥物的治療效果，同時使用中藥的患者需要特別注意。