肛裂長期發展下去，首先對肛門局部的損傷很大，皮膚全層裂開，會引起括約肌的痙攣、收縮，時間長以后，會出現括約肌功能勞累。肛門整個功能，即密閉、排便，排便肌肉協調、排便功能都會受到一定的影響。肛裂也容易感染，肛管處容易感染，容易引起肛竇炎、肛門皮下感染的膿腫，這是因為皮膚已經全層裂開，沒有表皮保護肛管，所以容易引起感染。 此外還會給病人帶來很大的痛苦，因為肛裂時比較疼痛，所以患者入廁排便是非常痛苦的事情。有的人形容肛裂的病人排便時是一種撕心裂肺的痛，確實是這樣。主要的危害是對身體的危害，還有在患者心理方面也能造成很大傷害。