輔酶Q10如果是由于疾病治療的需要，可以在醫生的指導下長期服用。輔酶Q10為慢性病治療用藥，一般需要服用較長時間，應在醫生指導下合理使用，加強監測，用藥過程中注意不良反應包括胃部不適，如食欲減退、惡心、腹瀉，以及心悸、皮疹等。輔酶Q10用于疾病治療時，主要適應證為營養心肌以及改善心肌代謝。用于部分疾病輔助治療時，如心血管疾病中病毒性心肌炎、慢性心功能不全、肝炎如病毒性肝炎、慢性活動性肝炎，癌癥綜合治療，減輕放、化療所引起部分不良反應癥狀。輔酶Q10臨床上有多種不同劑型，包括片劑、膠囊劑、軟膠囊劑等，劑型不同，規格不同，用法、用量有區別，患者需要加以注意。