男性尿道拭子檢查會痛，因為尿道拭子檢查，需要將尿道拭子插入尿道內，且要插到前尿道的后方，需要插的比較深。然后在尿道內輕輕的轉動，將尿道內的分泌液取出，這樣才可以取到有效的分泌液，檢查的結果準確性才高。男性的尿道主要有尿道黏膜，當尿道拭子插入后，就會刺激尿道黏膜，尿道黏膜神經末梢比較豐富，所以會有疼痛的表現。男性尿道拭子檢查雖然有疼痛，但是大多數人都可以耐受。其檢查的目的就是要取到分泌液，然后查找具體致病菌存在，再選擇敏感的藥物進行治療。在進行尿道拭子取分泌物的操作后，一定要多喝水、多排尿，可以吃廣譜抗菌素，避免檢查后尿道黏膜出血、水腫加重、疼痛加重的現象，以及進行尿道拭子檢查后患者的癥狀更加明顯的現象。