扁桃體最主要的功能是免疫防御功能，能夠分泌淋巴細胞和抗體，能夠抵御細菌和病毒的感染，位于咽部，是呼吸、說話以及進食的交通要道，當有細菌病毒感染時，扁桃體就起到了防御作用。所以在兒童時期，通常扁桃體都呈生理性肥大，通常是正常，在10-14歲左右會逐漸萎縮，在成人時免疫防御功能會逐漸減弱、消失。如果扁桃體反復發炎，因為細菌和病毒使扁桃體形成慢性炎癥，帶來的癥狀就比較重，會引起反復發熱、咽痛，甚至引起變態反應性疾病，引起關節炎、心臟病或者腎炎等，此時就需要將扁桃體切除。所以在扁桃體正常的時候，起到保護的作用，但是當扁桃體反復出現炎癥，就需要將其切除。