腸鏡通常指結腸鏡檢查，結腸鏡檢查主要查大腸。小腸和結腸接口的地方叫回腸末端，結腸鏡通過回盲瓣可以進到小腸內，但結腸鏡查小腸只能查10cm左右。因為小腸較長，可能達到幾米長，所以通過結腸鏡無法檢查小腸，只能看到回腸末端。如果是針對小腸腸鏡檢查，要通過小腸鏡檢查，不是結腸鏡檢查。小腸鏡與結腸鏡檢查外觀相似，但結構有差別，比如小腸鏡會帶氣囊，有雙氣囊的小腸鏡，也有單氣囊的小腸鏡。因為小腸鏡的檢查比較復雜，操作時間也比結腸鏡長。另外腸道的轉彎較多，對醫生的要求高，如果操作不慎，可以引起小腸穿孔。因此是否需要做小腸鏡檢查，通常由醫生根據患者的具體病情進行判斷。