當患者出現肛周膿腫時，建議進行急診手術。所有膿腫類似人體長得癤腫，但肛周膿腫位置位于肛門周圍，肛門內脂肪組織較多，可能局部膿腔較大，且脂肪組織沒有血運，則傷口恢復較緩慢。肛周膿腫手術，通常是切開引流，隨后傷口逐漸愈合。由于肛門周圍神經末梢較豐富，痛覺過于敏感，若肛周膿腫傷口較大，則患者術后疼痛較明顯。通常術后需進行長期坐浴，待到傷口基本恢復為止，可能需2-3周甚至更長時間。