通常巧克力囊腫術后注意事項，主要包括以下幾點：1、巧克力囊腫術后，要求術后隨訪；2、需要給予患者口服藥物治療，包括非甾體類消炎藥、口服避孕藥、孕激素類藥物，以及左炔諾孕酮宮內節育系統類，以延緩術后復發，減輕患者疼痛等癥狀；3、需要給予患者進行針劑治療，包括不同劑型的GnRH，即促性腺激素釋放激素。巧克力囊腫手術是標準治療辦法之一，術后患者還需進行藥物治療和長期管理，從而延緩復發，減輕癥狀。此外對于有生育要求患者，建議積極促孕，并尋求生殖科專家幫助。