腦膿腫晚期，即膿腫壁形成期，此時膿腫壁已經較完全、較厚，會引發患者急躁性神經癥狀、癲癇等。需進行手術切除，包括完整切除膿腫壁、膿腔，手術時一定要注意避免膿腫發生破裂，因為一旦出現破裂，有可能引發新的膿腫。患者再次出現腦膿腫，屬于非常嚴重的情況，而且也不利于盡快恢復，所以手術時一定要加強保護，謹慎操作。膿腫需按照膿壁的邊緣進行完整切除和剝離，只要手術時未出現腦膿液滲漏，結合術后應用抗生素4周左右，多數腦囊腫預后較好。