胃腸間質瘤預后與其分型、大小、侵襲性等密切相關，胃腸間質瘤是胃腸道常見的間質來源腫瘤，屬于交界性腫瘤，所謂交界性，即介于良性和惡性之間。間質瘤可分為低危、中危、高危，對于低危和中危情況，手術切除干凈后通常可以治愈。 對于高危情況，由于腫瘤較大，核分裂象比較多，展現出了一定侵襲性生長的生物學行為，因此預后比較差。此時需盡早處理，盡可能進行根治切除，如果是高危因素，還需口服1-3年，甚至更長時間的格列衛，以預防和減少胃腸間質瘤復發。