骶髂關節炎和強直性脊柱炎的區別，在于骶髂關節炎發生后，往往提示有可能是強直性脊柱炎，但骶髂關節炎患者，并不一定就存在強直性脊柱炎，而強直性脊柱炎的患者，最開始的表現就是骶髂關節的破壞。已經確診強直性脊柱炎的患者，通常伴隨著骶髂關節炎，但如果有骶髂關節炎，并不一定存在強直性脊柱炎。在臨床上，如果患者出現慢性腰背部疼痛，應懷疑可能有強直性脊柱炎，此時會做骶髂關節的影像學檢查。如果確認骶髂關節有強直性脊柱炎，甚至有骶髂關節融合的表現，此時要懷疑可能存在強直性脊柱炎，因此要去抽血檢查，做血沉、C反應蛋白，以及HLA-DRB1基因的檢查。同時還要結合癥狀，是否伴隨炎性腰背部疼痛。如果患者癥狀、實驗室檢查，以及骶髂關節炎都符合特點，才能夠確診為強直性脊柱炎。但如果僅有骶髂關節炎，沒有腰背部疼痛，沒有晨僵，沒有關節活動受限，沒有胸廓活動受限，則僅是存在骶髂關節炎，并不能確診為強直性脊柱炎，這是兩者的區別。