牙齦乳頭炎在臨床上經常與急性牙髓炎和牙齦炎鑒別，常見情況如下：1、急性牙髓炎：通常壞牙會有齲洞，且齲洞較深，疼痛是自發性的陣發性劇烈疼痛，夜間加重，冷熱刺激可以引起疼痛，早期冷刺激可以緩解疼痛，晚期冷熱刺激不能緩解疼痛，只能使疼痛加重，且患者不能指出出現明顯疼痛的牙齒。而急性牙齦乳頭炎，患者可以明確指出明顯疼痛的牙齦乳頭部位，檢查部位時，此部位的牙齦乳頭有明顯紅腫，在探診或觸碰時有出血現象。牙齦乳頭下方可能會有食物殘渣軟垢、牙菌斑，除細菌感染，還可能是有牙齒鄰面充填物有懸突，壓迫牙齦乳頭，或局部有不良修復體壓迫牙齦乳頭，從而引起牙齦乳頭腫大、疼痛；2、急性牙齦炎：除牙齦乳頭外，還包括牙齦炎，整個牙齦或大部分牙齦都會出現明顯紅腫，主要是細菌作用的結果，在牙頸部附著牙石和菌斑，上面附著的細菌利用食物殘渣軟垢分解產生毒素，刺激牙齦使牙齦發炎，而出現紅腫和疼痛，部位不僅局限于牙齦乳頭，也會在觸碰刷牙時引起出血現象，局部找不到有充填物或不良修復體。