腦干輕微損傷有機會恢復，如果是點片狀出血，患者出現癥狀相對比較輕微，這類患者預后非常良好，日后可能不會留下后遺癥。 但是腦干損傷不同，會引起患者出現長時間昏迷，而昏迷一般會造成植物狀態，即植物人。一旦出現這種狀況，患者可能會面臨氣管切開或者氣管插管、機械通氣，患者臥床后會出現相應肺部炎癥、褥瘡、下肢靜脈血栓、尿路感染等并發癥。出現并發癥會大大延長患者恢復時間，也會給患者增加更多復雜病癥。 因此，原發性腦干損傷恢復要取決于腦干損傷程度，但是腦干損傷一旦形成，遺留下后遺癥的可能性極大。