地中海貧血主要危害表現為與貧血相關的癥狀，若患者屬于輕度貧血則通常沒有明顯表現。但如果出現中度貧血，部分患者可能出現乏力、頭暈、體力下降等癥狀，若為重度地中海貧血，則患者除上述表現外，會出現脾臟腫大，甚至部分地中海貧血患者成年后會出現巨脾表現。對于地中海貧血所引起的巨脾患者而言，會產生腹痛、腹脹等癥狀，嚴重者會引起脾栓塞。若胎兒期存在地中海貧血，可能導致胎兒在母體內死亡。總而言之，地中海貧血主要危害與貧血程度和基因突變雜合或重合有關，患者會因此而有不同癥狀表現。