高膽固醇血癥的危害主要是會引起心血管疾病，即動脈粥樣硬化性心血管疾病。當膽固醇水平升高的時候，會在血液內隨著血液流動到組織的器官進行沉積，如果沉積在肝臟會引起脂肪肝等。如果沉積在血管內壁，會引起血管內的粥樣硬化斑塊的形成，引起血管狹窄以及相應的心血管事件，比如引起冠脈狹窄會引起冠心病，誘發心梗、惡性心律失常、心源性休克等。 如果沉積在腦血管，引起腦動脈粥樣硬化，腦動脈狹窄會誘發腦梗，大面積腦梗甚至腦梗之后的出血等腦血管意外事件。如果在下肢動脈，會引起下肢動脈缺血，出現間歇性跛行的癥狀。如果在腎臟，會引起腎衰等一系列并發癥。