艾普拉唑和奧美拉唑的區別，主要在于代謝途徑。無論是艾普拉唑還是奧美拉唑，都屬于質子泵抑制劑，主要作用是抑制胃酸分泌，它們都屬于苯并咪唑類的結構以及它的衍生物。臨床上經常用到的質子泵抑制劑，包括奧美拉唑、雷貝拉唑，還有蘭索拉唑、泮托拉唑等，主要經過肝的藥酶系統P450的代謝系統，經CYP2C19酶代謝。若同樣服用經過CYP2C19酶代謝的藥物，可能會影響到藥物代謝，導致血漿中的藥物濃度出現變化，可能會帶來一些治療上以及不良反應上的差別。人的CYP2C19酶存在基因多態，基因多態帶來的臨床影響，主要是不同人的藥物代謝速度不一樣，如快代謝型、中間代謝型、慢代謝型，對于快代謝型的患者，如果服用相同的藥物劑量，可能臨床療效就會受到一些影響。通常在處方這一類藥物的時候，一般不會建議每個病人都做CYP2C19基因多態性的檢測。如果希望(藥物)的抑酸效果比較好，就會盡量選擇受CYP2C19代謝影響小的藥物，如艾普拉唑，該藥物主要由3A4代謝，其代謝途徑和奧美拉唑不一樣。