小腿肚子酸痛的病因，主要有以下幾種：1、肌肉勞損：最常見的原因是肌肉的勞損，如過度鍛煉或者肌肉長時間處于收縮狀態，可導致無氧代謝增多，引起乳酸等局部有害產物堆積過多或者肌纖維受損，從而導致酸痛；2、血液循環不暢：下肢靜脈曲張、局部血栓形成等，也可以導致小腿的酸痛；3、神經刺激：當支配腿部背側肌肉的神經受到刺激，同樣也可以導致酸痛的產生，如椎間盤突出波及神經；4、炎癥感染：小腿骨骼因退行性變出現骨炎或者軟組織感染時，局部也可以有酸痛的表現。如果小腿持續酸痛，休息后不緩解。建議去醫院進行相關的檢查，從而明確診斷，給予對癥治療。