牙齒上有黑點的病因較多較復雜，具體如下：1、齲壞：對于牙齒有淺齲、中齲、深齲的患者，均有可能會出現黑點，建議及時到正規醫院的口腔科，或者是口腔醫院的牙體牙髓病科，找專業的口腔科醫生進行檢查。根據性質進行相應地去齲，進行沖洗、消毒、隔濕、吹干以后，進行窩洞的充填修復等；2、色素沉著：應該及時的進行全口潔治，進行相應的沖洗、上藥等，則可以較好較快地解決此問題；3、牙釉質發育不全、牙本質疾病：均有可能會表現為牙齒出現黑點，可能考慮進行相應的輔助治療，包括全冠修復以及相關治療等，根據不同患者以及個體差異，選擇不同的治療方案。