肺孢子菌肺炎是機會性感染疾病，常見于免疫力功能低下的患者，是最常見的嚴重機會性感染疾病。 感染途徑一般為空氣傳播和體內潛伏性的狀態的肺孢子菌的激活。常見于免疫力低下，比如有艾滋病的病人或者是有腫瘤、血液病的病人。治療除對癥治療與基礎疾病的治療外，還需針對病原治療。 目前首選復方磺胺甲惡唑，即復方新諾明，若過敏或者是應用效果不好，則選用利奈唑胺、卡泊芬凈等比較新的藥物。但是這種疾病總體上治療效果差，預后不佳，療程也比較長，治療起來比較困難。 肺孢子菌肺炎治療主要是建立在診斷的基礎上，如果病人有低熱、咳嗽、咳痰，而且有基礎疾病的病人，在臨床上要提前考慮到該疾病可能存在。