神經內鏡需要開顱，只是開顱的范圍和大小比傳統顯微鏡手術要小很多。老百姓認為開顱需要頭皮切開頭蓋骨打開，神經內鏡開顱比顯微鏡開顱方式要小，內鏡不需要那么大的空間，而且現在更多的腫瘤是兩種手段結合，比以前的開顱范圍更小，但是仍可以用顯微鏡操作。 還有一種手術不是切開頭皮，通常重要的神經內鏡手術是經鼻子，也是開顱，只是不需要一層一層的切開頭皮，需要把黏膜切開，到達顱內時打開顱骨，顱骨后邊的硬膜也需要切開，也是開顱過程。