巧囊指的是巧克力囊腫，巧克力囊腫手術后通常卵巢功能不會受到明顯的影響。巧克力囊腫手術根據手術部位、手術范圍不同會有較大差別。考慮巧克力囊腫發病的高發年齡段是生育年齡的女性，進行巧克力囊腫手術時為了保留她的生育能力，所以不會對卵巢造成特別嚴重的功能上的破壞。進行巧克力囊腫手術時，會比較輕柔的將囊腫的病變部位切除，盡可能保留較多的卵巢皮質、髓質。無論采取電凝或是手術縫線縫合的方法，都能達到非常確切的止血目的。同時女性的卵巢功能非常強大，保留少許卵巢皮質、組織，通過充足的血液循環，未來排卵、受孕不會有較大影響。所以為了保護生育力、卵巢功能，需要避免巧克力囊腫持續性變大、反復破潰導致周圍的粘連，影響卵巢功能，建議進行手術。