低位單純肛瘺的復發(fā)率比較復雜。首先低位單純肛瘺治療方法現(xiàn)在非常多，手術(shù)方法包括切開引流、切開掛線、竇道切除、瘺管剔除、真皮填塞修補等，不同方法復發(fā)率也不同。 最有效的治療方法是將竇道、瘺管切除，整個瘺管切除以后、感染原和感染灶全部清除以后傷口逐漸愈合，復發(fā)率非常低。而如果是采用其它所謂的微創(chuàng)、減少創(chuàng)面的方法，比如真皮填塞，現(xiàn)在還有肛瘺栓填塞，即將部分肛瘺竇道清理干凈以后，將可以刺激肛門周圍的生長物填塞進去。上述情況相對屬于盲操作，即竇道不能完全打開，可能導致竇道探查并不是百分之百準確，復發(fā)率相對高一點，大部分統(tǒng)計在15%-20%之間。而完全竇道切除的復發(fā)率極低，可能在10%以下。