慢性扁桃體炎可分為急性發作期和穩定期，穩定期的慢性扁桃體炎通常不需要治療。急性發作期的慢性扁桃體炎，可按照急性扁桃體炎進行治療，可應用抗生素，采用頭孢類或者青霉素類的藥，通過口服或者靜脈輸注皆可。通過幾天的抗生素治療，通常扁桃體炎就會得到控制。當炎癥比較明顯時，還可以通過霧化吸入糖皮激素的方式，迅速改善咽部的癥狀。通常可以用普米克令舒(布地奈德混懸液)做霧化吸入，咽部的急性炎癥可得到迅速恢復。除此之外，還可應用物理的治療方式。例如通過鹽水含漱或者含漱液含漱可以減輕咽部炎癥，還要注意對病人進行一定的對癥治療。如果出現明顯的高熱，可以給予退熱治療。如果病人咽痛比較明顯，也可以給予解熱鎮痛劑，使病人發熱得到緩解，也可使病人的咽痛得到明顯改善。同時讓病人多休息、多飲水，經過一段時間的藥物治療，慢性扁桃體炎就會得到逐漸控制。