多數情況下患者尿路感染，服用甲硝唑并無作用，因為尿路感染引起的病原菌多為細菌，如革蘭氏陰性桿菌、大腸桿菌，而甲硝唑是抗厭氧菌抗生素，治療的細菌譜不同。對于革蘭氏陰性桿菌感染患者，服用甲硝唑效果不佳，建議使用頭孢類抗生素，如二代、三代頭孢，如頭孢克肟、頭孢地尼等。如果患者對于頭孢類藥物過敏，則可選擇喹諾酮類抗生素如諾氟沙星，或服用呋喃妥因、磷霉素等，均可有效覆蓋引起尿路感染的革蘭氏陰性桿菌。因此，并不推薦患者使用甲硝唑進行治療，建議使用其他有針對性、可覆蓋此類細菌、病原體的藥物進行治療。