癲癇手術術式不同，風險相對不同。癲癇手術包括很多個類型，如病灶切除、損毀手術以及現在比較流行神經調控手術。不同類型手術風險差異比較大，比如損毀性手術，有大腦半球切除術，療效比較好，但是損傷比較大，所以相對風險比較大。 現在比較流行神經調控，比如迷走神經刺激術，相對不開顱的手術，對腦神經損傷比較小。一般在胸口埋調控機子，通過電回路刺激達到治療癲癇效果，相對沒有神經損傷，所以風險比較少。總體來講，癲癇手術風險不大，只有個別損傷特別大或病灶特別大者的風險會比較大。