做清腸時要喝瀉藥、喝大量的液體。一般結腸鏡檢查清腸時是喝4袋，即4L復方聚乙二醇電解質散，一般在6小時左右都能夠完全排干凈。采取的方法一般是上午做結腸鏡，在前一天傍晚或者前半夜進行喝藥、喝大量電解質水，病人會逐步地跑廁所排便，排到清水樣便為最佳。一般在前半夜或者傍晚時喝藥，不影響后半夜的睡眠。如果是下午進行結腸鏡檢查的病人，有時候會讓他清晨4-5點起來開始喝瀉藥，到下午就已經排干凈，進行結腸鏡檢查即可。喝瀉藥能不能排干凈，跟病人既往的胃腸動力也有關系。如果喝進去大量的液體，比如喝2L還沒有一次有效地排便，最好找醫生灌腸，或者家里有甘油灌腸劑也可以自行塞肛，進行遠端干結糞便地引導，使之排出來。這時上邊水質多的糞便就會隨之往下走行，起到加速排空的作用。