肺結核傳染源主要是肺結核患者，排菌指患者呼吸、咳嗽、打噴嚏、吐痰時，從肺部排出結核菌，結核病因此而傳播，此段時期稱為排菌期。肺結核排菌期無固定時間，每人病情以及用藥情況不同，給予患者正規抗結核治療，1-2周傳染性可大大下降甚至不出現排菌，部分患者1-2個月以后排菌轉為陰性。 部分患者不規則用藥可能會長期慢性排菌，耐藥患者排菌期較長，甚至一直排菌，需要更換更為敏感的抗結核藥物病情才會得到控制。凡是痰中找到結核桿菌的患者，外出應該佩戴口罩，避免對他人面部講話或隨地吐痰。痰液應吐在手帕或廢紙內，集中消毒或用火焚燒，同時養成分食制習慣。