若腎結石直徑大于0.6cm，通常難以自行排出，患者可以考慮進行手術治療。但結石的大小并非唯一衡量手術治療的標準，對于小結石，患者通常可以選擇排石治療。對于直徑大于0.6cm的結石，若生長緩慢，未引起腰痛、血尿、感染等癥狀，或位于腎盞以及憩室內，且未引起明顯的危害，則患者可采取非手術治療。若結石位于無功能的一側腎臟，未引起明顯的積水或梗阻，且對側腎臟功能良好，也可以采用非手術治療。對于直徑大于0.6cm的結石，通常應首選體外碎石，若體外碎石效果不佳，患者才需要考慮手術。手術可以選用輸尿管軟鏡或經皮腎鏡，對于直徑小于2cm的結石，患者可以考慮使用輸尿管軟鏡進行治療。因為軟鏡創傷小，患者的身體恢復較快且出血風險較低，對身體的影響較小。但由于軟鏡較細，碎石較慢，所以清石效率低。而對于較大的結石，如直徑大于2cm的結石，患者通常應使用經皮腎鏡進行治療。因為經皮腎鏡的通道較寬闊，碎石效率較高，清石也比較快速。目前較少使用腹腔鏡切開取石或開放手術，但在特殊的基層地區，仍然可以考慮進行。