兒童系統性紅斑狼瘡是十分復雜的疾病，全身多器官、多系統都能引起損傷。狼瘡腦病可以引起死亡，該病還可以引起心包炎，同樣可以引起死亡。狼瘡引起的腎衰也可以引起死亡，狼瘡后全身多器官多系統損傷比較嚴重，因此還可以出現感染。 狼瘡感染對于兒童的死亡率非常高，其可能是死亡里相對較多的病因。近年來狼瘡死亡率比較低，是因為狼瘡抗感染治療比較有效。在過去沒有多種抗生素可用于治療，現在治療狼瘡原發病的方法也與原來不一樣，所以狼瘡預后跟原來有明顯改善。 治療的目的是讓狼瘡病人像正常人一樣生活，可以上學，結婚，甚至生育，但是狼瘡患者的死亡病因主要是多器官、多系統損傷引起的感染，也可能是同時多個器官損傷衰竭而引起死亡。