做膽總管囊腫手術以后，寶寶最主要的后遺癥，可能是吃油膩性的食物以后出現腹瀉、脂肪瀉、消化不良的情況。有些寶寶腹部做過手術，因為有腸道吻合口、腸道和膽道的吻合口，可能會有粘連性腸梗阻、腹痛的情況。有些寶寶可能因為逆行的膽道感染，會有發熱、肝區的疼痛、轉氨酶升高、肝功能損害的情況。但是并不是所有的寶寶在做完此類手術以后，都會出現以上情況。如果要了解寶寶出現上述后遺癥的原因，則要了解做囊腫手術的手術過程和手術方式。在手術過程中，需要將遠端擴張的膽囊管完全切除。在切掉以后，近端的膽管和小腸做吻合，膽汁則直接流到小腸內部。與此同時，小腸自身和近端的腸管也有端側吻合的吻合口。兩個吻合口，一個流食物即流消化液，另外一個留膽汁，食物在小腸內充分混合、消化。所以在兩個吻合口的吻合過程中，術后可能出現膽瘺、腸瘺的風險。在寶寶做完手術以后，要充分禁食7天以上，才能吃飯。寶寶在做完手術以后，因為膽道系統結構發生變化，膽汁直接入腸道，所以可能造成脂肪消化不良、食物消化不良。而腹部做手術可能有腹痛，腸道和膽道直接做吻合可能會逆行感染。做膽總管囊腫手術以后，寶寶可能會出現以上后遺癥，但并不是每個寶寶都會發生。在做完手術以后，要定期復查。一旦出現腹痛、發熱的情況，及時查彩超、肝功，了解是否有其他病變的發生。