胎兒染色體異常的原因通常包括以下幾點：1、胎兒自身發育異常：通常可以導致胎兒染色體數目異常，如21-三體，若受精卵形成時分裂出現異常，則會導致21-三體等異常情況的出現。而胎兒染色體微缺失、微重復等結構異常多數是在染色體形成過程中或受精卵分裂的過程中發生的輕微異常；2、父母雙方染色體異常：胎兒染色體異常在個別情況下與父母雙方相關，因為父母雙方也可能帶有微缺失或微重復的染色體。如果通過檢查發現父母雙方染色體雖然存在異常，但未發生異常表型，則微缺失、微重復屬于正常現象，則可以繼續妊娠；3、基因突變：若排除上述情況，則屬于胚胎發育過程中發生基因突變所致，應及時終止妊娠以免出現異常表型。