患者牙根發黑，原因及治療方法具體如下：1、齲壞：可能會出現發黑的現象，需要進行充分去齲，沖洗、消毒、隔濕、吹干后，再進行窩洞的充填修復，將牙根發黑的地方用材料補起來，可以解決牙根發黑的問題；2、牙結石：牙根部位有大量牙結石、菌斑以及色素沉著，牙根逐漸變成黑褐色?？梢酝ㄟ^全口潔治，特別是齦下刮治，可以將牙齒牙根部的異物清除，牙根發黑的問題可以得到較好的解決；3、重金屬超標：建議患者少接觸富含重金屬的物質，多喝水，觀察是否能夠緩解病情。