胃鏡檢查時的不適其實并不是疼痛感，而是會出現咽部不適感以及惡心、嘔吐等癥狀。當進行普通胃鏡時，受檢者會在術前口服利多卡因，這種麻醉藥可以使咽部在做鏡檢時的刺激減少，從而減緩咽部不適。但對于慢性咽炎的患者或既往咽部反射較為嚴重的患者，此時還會出現咽部不適感以及惡心、嘔吐。絕大多數受檢者在胃鏡檢查的過程中，并不會感覺到胃部疼痛。為了減輕患者的恐懼與焦慮以及避免不適感，目前存在無痛胃鏡，即在檢查時通過靜脈點滴輸注短效麻醉藥物，使患者處于無意識狀態后再做檢查，患者既不會有咽部的不適，也不會有惡心、嘔吐的癥狀。目前，胃鏡檢查是較為成熟的檢查方法，如果患者對普通胃鏡不耐受或者過于焦慮、緊張，則可以選擇無痛胃鏡進行檢查。