經皮腎鏡屬于微創性檢查，對腎臟影響比較小，患者手術的開口較小，同時術中出血也會比較少，術后恢復也快。通常經皮腎鏡主要用于直徑超過1.5cm的腎結石，或者是超聲波碎石難以碎掉的腎結石，以及造成嚴重腎積水的輸尿管結石患者，可以用經皮腎鏡將石頭取出。術后患者由于創傷比較小，因此恢復時間會比較快，相對是安全性比較高的一種手術，同時經皮腎鏡，對腎功能通常沒有較多影響。因此，對于有腎結石，同時經過超聲波碎石沒有解決或者是腎結石體積比較大，以及造成嚴重腎積水的腎結石患者，可以考慮用經皮腎鏡，然后進行取石的手術。