胎停育發生的原因，涉及到很多不同方面，整體數據上2/3以上，與胚胎本身先天染色體基因重大疾病相關。因此生長發育早期，被自然淘汰，如果只是偶然發生1次胎停育，無需過于擔心，可能為一次優勝劣汰，未來懷孕不會受到過多影響。如果頻繁發生2次，甚至3次以上胚胎停止發育情況，夫妻雙方應進行相應檢查，如染色體疾病，有時可能是父源或者母源本身攜帶基因異常的問題。母體疾病如高血壓、糖尿病。有時可為潛在以胎停育為首要表現的風濕免疫科疾病，如抗磷脂綜合征，及其他較少見的疾病。