萎縮性胃炎腸化生是指胃鏡下標本中，可能肉眼看到有灰白色結節，或者用染色技術發現有結節，則考慮為腸上皮化生。腸上皮化生是指胃黏膜發生變化，不是原有胃底腺、幽門腺細胞，而是出現含有杯狀細胞的腸上皮化生，即腸上皮細胞。根據整個活檢標本內腸化細胞比例，分為輕、中、重度的腸上皮化生。如果胃黏膜變成為典型的腸黏膜也可以稱為腸上皮化生，如果既不像典型胃黏膜，也不像典型腸黏膜，稱為異型增生。異型增生又分為輕、中、重度。輕、中度的異型增生屬于低級別上皮內瘤變，重度異性增生和原位癌便只有一步之遙，二者可以結合稱為高級別上皮內瘤變。萎縮性胃炎的觀測除腸上皮化生外，還需觀察腺體減少和炎癥細胞的浸潤程度，也可給出輕、中、重度的不同分級。