慢性萎縮性胃炎伴有腸化生的治療具體如下：1、明確病因：大多數病人出現這種狀態與幽門螺桿菌的感染有很大的關系，對于這樣的病人，要進行幽門螺桿菌的檢測；2、清除幽門螺桿菌四聯方案：如果有幽門螺桿菌的感染，需要清除幽門螺桿菌。清除幽門螺桿菌目前常用的還是四聯方案，也就是質子泵抑制劑聯合鉍劑、兩個抗菌素來進行治療，療程是兩周，這是針對幽門螺桿菌感染的病因的治療。從理論上而言，進展到慢性萎縮性胃炎伴有腸化生的狀態之后很難逆轉。但是清除了幽門螺桿菌以后，可以阻止疾病的繼續進展，也可能會使得程度變輕，這是治療的結果；3、使用內源性黏膜保護劑：目前還有具有促進上皮細胞增生、改善黏膜的血供、增加黏膜的營養、增加黏液的分泌、調節上皮細胞黏膜免疫等作用的黏膜保護劑，稱為內源性黏膜保護劑，比如替普瑞酮、索法酮、聚普瑞鋅等。具有這些作用的藥物從機制上而言，可能有一部分能夠促使萎縮好轉、腸化好轉的效果，可以嘗試使用。但是目前沒有權威的指南或者是專家共識，有關于慢性萎縮性胃炎伴有腸化生的藥物的推薦，對于這樣的治療方法，可以進行嘗試；4、使用中成藥：比如胃復春以及摩羅丹，從批準的適應證上來看，有治療慢性萎縮性胃炎伴有腸化生的作用，也可以嘗試，但是相信這種治療時間比較長。慢性萎縮性胃炎伴有腸化生的病人，除了采用上述藥物治療之外，還要定期隨訪，這也是非常重要的治療過程。