對于臨床檢查，核磁共振與CT兩者各有優勢、相輔相成、缺一不可。 核磁共振作為目前比較先進的一項影像學檢查技術，是利用體內氫質子成像，是無輻射的檢查手段，但是掃描速度比較慢，而CT雖然有輻射，但是掃描速度快，在急診外傷中應用更為廣泛。 兩者之間各有側重點，磁共振更側重于軟組織檢查，比如頭顱、肝臟等一系列的軟組織，可以幫助醫生在早期腦中風對患者進行評估，還有乳腺、關節等一系列檢查，磁共振都具有相當大的優勢。對于CT來說，則更側重于觀察肺或骨折相關疾病。