一般扁桃體腫大的患者可以做核酸檢測。核酸檢測為取鼻腔或者咽部的分泌物作為樣本，檢測感染病毒核酸是否存在，通常與扁桃體腫大沒有相關性。核酸檢測在臨床上可能會出現假陽性、假陰性的情況，需要反復多次取樣本和檢測，直到檢查結果一致，再做最后的診斷。扁桃體腫大臨床較為常見，急性扁桃體炎造成的扁桃體腫大。患者常因細菌感染而導致，表現為咽痛、發熱，檢查發現扁桃體充血、腫大，嚴重的患者表面可見膿性分泌物。扁桃體的生理性肥大多見于青少年，平時無自覺癥狀，如出現異物感、堵塞感、講話含水音、睡眠打鼾等癥狀，需要進行臨床處理。慢性扁桃體炎增生、肥大，為急性扁桃體炎反復發作而導致，造成纖維組織及淋巴組織的增生、腫大，如慢性扁桃體肥大引起全身的并發癥，通常為手術摘除的指征。