腎小管酸中毒在早期代償期沒有明顯的臨床癥狀，隨著腎小管酸中毒的加重，患者可以出現厭食、惡心、嘔吐、心悸、氣短，甚至還可以出現深大呼吸以及神智障礙。對于嬰幼兒血小管酸中毒，會影響其生長發育，使得生長遲緩。同時常見的Ⅰ型腎小管酸中毒和Ⅱ型腎小管酸中毒，還會合并有低鉀血癥，低鉀血癥會有低鉀的癥狀，比如出現骨骼肌無力，患者會出現乏力疲軟，平滑肌無力也會出現惡心、嘔吐、腸麻痹、尿潴留等，還會出現心律失常以及低鉀性的腎病，出現腎性的尿崩癥，明顯的多尿癥狀。Ⅰ型腎小管酸中毒的患者，還可能會出現明顯的鈣磷代謝紊亂，出現低血磷、高尿磷，從而出現繼發性甲旁亢，在成人會出現軟骨病，嬰幼兒可能會出現佝僂病。總之腎小管酸中毒，可以帶來各種臨床上的并發癥和部分臨床表現，發現血小管酸中毒的患者，需要進行積極地處理，尋找病因。