非結核分枝桿菌和結核分枝桿菌的區別是非結核分枝桿菌指分枝桿菌屬中，除結核分枝桿菌復合群和麻風分枝桿菌以外的其它分枝桿菌。 目前已經發現有150多種非結核分枝桿菌，并不是所有的非結核分枝桿菌對人體都致病，只有少部分致病，而且非結核分枝桿菌在人類平時生活的環境中存在，像土壤、管道水、空氣中都含有非結核分枝桿菌。 結核菌是導致人類結核病的病原體，如果感染肺部則稱為肺結核。肺結核可以通過患者打噴嚏、咳嗽、痰、飛沫傳播，屬于乙類傳染病，與非結核分枝桿菌病并不相同。